Недавно,Кинески CDC недељникобјавио је важан истраживачки чланак који описује епидемиолошко и етиолошко истраживање акутне епидемије гастроентеритиса изазване ротавирусом групе Ц (RVC) у основној школи у Луџоуу, провинција Сичуан, у октобру 2025. године. Приметно је да су Macro & Micro-Test-ов комплет за циљано хватање патогена (probe-capture) са високим пропусним капацитетом и технологија секвенцирања обогаћивања целог генома одиграли кључну улогу у истраживању. Омогућавајући тачну идентификацију патогена и свеобухватну геномску карактеризацију, технологија је пружила кључне научне доказе за брзу потврду епидемије, прецизно праћење извора и ефикасну контролу епидемије.
Изненадна епидемија: Прва пријављена епидемија РВЦ-а у југозападној Кини
Дана 15. октобра 2025. године, у основној школи у Луџоу догодила се епидемија акутног гастроентеритиса. Школа је имала укупно 1.943 ученика и запослених, са 32 пријављена случаја, укључујући 6 лабораторијски потврђених и 26 клинички дијагностикованих случајева, што је резултирало укупном стопом обољења од 1,65%. Епидемија је достигла врхунац између 15. и 16. октобра, са највећом стопом обољења у 7. разреду, 5. разреду (23,08%). Већина пацијената била су деца школског узраста (средња старост: 10 година), првенствено са повраћањем (65,62%), дијарејом (46,87%) и боловима у стомаку (37,50%). Симптоми су обично трајали 1-3 дана, а сви пацијенти су се опоравили без тешких компликација.
Епидемиолошка истрага је идентификовала индексни случај као једанаестогодишњег дечака у 7. разреду, 5. разреду. Његова млађа сестра је развила сличне симптоме пре њега, што указује на кућно преношење као почетни извор. Неадекватно управљање повраћањем на кампусу - укључујући директно чишћење и одлагање без благовремене дезинфекције или изолације подручја - у комбинацији са лошом хигијеном руку међу ученицима, вероватно је олакшало даље преношење. Већина погођених учионица налазила се између другог и петог спрата и делила је суседне мушке тоалете, што указује да су и аеросолни и контактни пренос могли допринети ширењу.
Истрага је постала посебно изазовна јер је рутински скрининг патогена, укључујући тестове за норовирус и ротавирус групе А, дао негативне резултате, што указује да је одговоран неуобичајени патоген.
Етиолошка дијагноза: Секвенцирање целог генома макро и микро-тестом идентификује кривца
Почетно тестирање на норовирус било је негативно. Центри за контролу и превенцију болести Луџоу су потом користили мултиплексни PCR тест у реалном времену за гастроинтестиналне патогене, способан да истовремено детектује 28 патогена, укључујући 8 вируса, 17 бактерија и 3 паразита, како би скринирали осам клиничких узорака. Дана 17. октобра, шест узорака је било позитивно тестирано на ротавирус групе Ц, чиме је успешно идентификован узрочни патоген.
Да би даље пратили извор епидемије, истраживачи су извршили и метагеномско секвенцирање нанопора и секвенцирање обогаћивања целог генома помоћу хватања сонде компаније Macro & Micro-Test на пет позитивних узорака. Овим приступом је успешно генерисано пет комплетних секвенци генома RVC (SC01–SC05). Интегрисана стратегија брзог мултиплекс PCR скрининга, праћена секвенцирањем целог генома високе резолуције, пружила је снажну техничку подршку за прецизну молекуларну епидемиологију и праћење извора.
Научни увиди: Прва идентификација генотипа М2 у југозападној Кини
На основу висококвалитетних података целог генома генерисаних коришћењем Macro & Micro-Test технологије, истраживачки тим је известио о неколико важних научних налаза:
Потврда моноклонске епидемије:Свих пет вирусних изолата делило је идентичан генотип целог генома (G4-P[2]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2), са само 0–1 разликама у полиморфизму једног нуклеотида (SNP), што несумњиво показује да је епидемија настала из једног ланца преноса.
Откриће М2 генотипа:Филогенетска анализа је показала да сојеви Луџоу РВЦ припадају М2 генотипу, а не М3 генотипу који се раније сматрао доминантним међу кинеским сојевима РВЦ. Ово откриће доводи у питање конвенционално разумевање дистрибуције генотипа РВЦ у Кини и потврђује појаву М2 генотипа у југозападној Кини.
Докази о међународним преносним везама:Поређење целог генома показало је високу генетску сличност између сојева Луџоу и сојева РВЦ који су претходно пријављени у Јунану (2025), Новосибирску, Русија (2017) и Италији (2012), што указује на постојање активне евроазијске преносне мреже.
Импликације за превенцију и контролу: Рано откривање и брза интервенција су неопходни
Након идентификације патогена, Центри за контролу и превенцију болести Луџоу одмах су имплементирали свеобухватне мере контроле, укључујући изолацију случајева, дезинфекцију околине, стандардизовано управљање повраћањем и привремену обуставу наставе. Епидемија је успешно обуздана у року од једног инкубационог периода, без пријављених додатних случајева након 21. октобра.
Истрага такође пружа важну лекцију јавног здравља: за кластерне епидемије гастроентеритиса које су негативне и на ротавирус групе А и на норовирус, ротавирус групе Ц и друге ротавирусе који нису из групе А треба укључити у рутински дијагностички скрининг.
Ова студија представља прву пријављену епидемију ротавируса групе Ц у југозападној Кини и прву идентификацију генотипа М2 у региону, проширујући тренутно разумевање епидемиологије ротавируса у Источној Азији. У овом истраживању, интегрисано решење компаније Macro & Micro-Test, које комбинује мултиплекс PCR скрининг са секвенцирањем обогаћивања целог генома, показало је значајну практичну вредност омогућавајући брзу идентификацију патогена и молекуларно праћење извора високе резолуције, пружајући репродуктивни технички оквир за прецизно истраживање и контролу будућих епидемија заразних болести.
Време објаве: 30. јул 2026.