Прва анализа праћења Brucella abortus заснована на целом геному у провинцији Џеђанг – Биоинформатички тим из Macro & Micro-Test доприноси заједничкој публикацији

—— Заједничка студија коју су спровели ЦДЦ из Џеђанга, Макро и микро-тест и ЦДЦ Кине, објављена у часопису Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

Преглед студије

У мају 2026. године, часопис Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (JCR Q1, IF ≈ 4.6) објавио је рад који је водио Центар за контролу и превенцију болести провинције Џеђанг (Zhejiang CDC), са биоинформатичким тимом из Beijing Macro & Micro-Test Bio-Tech Co., Ltd. и Националним институтом за контролу и превенцију заразних болести (China CDC) као коауторима. Студија носи наслов:
„Идентификација и филогенетска анализа седам сојева Brucella abortus у Џеђангу, Кина.“
Бруцела абортус

Ова студија представља прву систематску анализу филогенетске следљивости Brucella abortus (B. abortus) засновану на целом геному у провинцији Џеђанг, Кина. Тим је анализирао седам изолата прикупљених од 2015. до 2025. године (четири соја људског порекла и три соја говеђег порекла из Ђинхуе, Ћуџоуа и Нингбоа). Резултати пружају геномске доказе о пореклу и путевима преношења ове „северне доминантне врсте“ у атипичном јужном епидемијском региону источне Кине.

 

Позадина и значај

 

Бруцелоза је зоонотска болест коју изазивају бактерије из рода Brucella. Brucella abortus првенствено инфицира стоку, али може изазвати болест и код људи. У Кини, бруцелоза показује изражене географске варијације: највећа инциденца се јавља у северним провинцијама (нпр. Унутрашња Монголија, Шанси, Хејлунгђанг). Насупрот томе, јужне провинције, укључујући Џеђанг, историјски су биле доминиране Brucella melitensis, са врло мало пријављених случајева B. abortus. Ова регионална разлика чини генетску карактеризацију и праћење извора B. abortus у Џеђангу кључним приоритетом јавног здравља.

 

Методе и кључни налази

Истраживачки тим је усвојио вишеслојну стратегију која комбинује молекуларну биологију и биоинформатику:

1.Идентификација патогена и основна типизација

ПЦР гена BCSP-31 и AMOS-PCR потврдили су да су свих седам изолата B. abortus.

Мултилокусна секвенцијална типизација (MLST) заснована на девет кућних гена открила је да сви изолати припадају типу секвенце ST2, што указује на високу генетску хомогеност међу циркулишућим сојевима B. abortus у Џеђангу.
Идентификација патогена и основна типизација

2.Карактеризација целог генома

Секвенцирање целог генома је извршено на платформи Illumina NovaSeq. Анализа просечног идентитета нуклеотида (ANI) показала је да изолати из Џеђанга деле до 99,99% сличности са референтним сојем B. abortus 544.

Пан-геномска анализа открила је високо конзервирану популацију: идентификовано је 3.084 језгра гена, заједно са само 10 гена љуске, а нису откривени гени меког језгра или облака.

图片1

 

3.Профили гена вируленције и антимикробне резистенције

Укупно је предвиђено 68 фактора повезаних са вируленцијом, који покривају класичне путеве као што су биосинтеза ЛПС, систем секреције Т4СС и двокомпонентни регулаторни систем BvrR-BvrS. Приметно је да свим изолатима недостају адхезински гени bmaA и btaF. Анализа гена отпорности открила је само ген mprF у CARD бази података, без идентификованих других детерминанти отпорности.

Вируленција4. Филогенетска реконструкција и праћење преноса

Анализа једнонуклеотидног полиморфизма језгра генома (cgSNP) поставила је изолате из Џеђанга на специфичну позицију у глобалном филогенетском стаблу. Резултати су показали да сојеви из Џеђанга чине монофилетску групу заједно са сојевима из Русије, Монголије и неколико северних кинеских провинција (Нингсја, Хејлунгђанг, Унутрашња Монголија, Хебеј, Гансу, Пекинг). Ова група се даље дели на три различите подкладе (кладе 1–3), што указује на вишеструке независне догађаје увођења.

Филогенетска реконструкција

Закључци и импликације

 

Ова студија пружа први високо прецизни геномски скуп података о бактерији B. abortus у провинцији Џеђанг и доноси неколико кључних закључака:

 

  1. Клеar генетска позадина– Сојеви B. abortus који циркулишу у Џеђангу припадају ST2 групи, геномски су високо конзервирани и представљају типичну лозу говеђе бруцелозе.

 

2. Евиоднос међурегионалног преноса– Филогенетска анализа не подржава постојање независне ендемске лозе у Џеђангу. Уместо тога, подаци снажно указују на то да ови сојеви потичу из северне Кине и да могу делити заједничку еволутивну позадину са сојевима из Русије и Монголије. Присуство три подкладе имплицира вишеструке одвојене догађаје увођења.

 

3. Импликације за јавно здравље– Резултати истраживања наглашавају вредност геномског надзора за бруцелозу чак и у традиционално неендемским регионима као што је Џеђанг. Иако је тренутни број случајева низак, алати високе резолуције попут cgSNP могу ефикасно пратити извор увезених епидемија и пружити научне доказе за прекидање ланаца преноса повезаних са међупровинцијским транспортом стоке.

 

Овај рад не само да попуњава празнину у истраживању у провинцији Џеђанг, већ пружа и нове основне податке за надзор патогена и процену ризика од бруцелозе у региону делте реке Јангце.

 

Информације о папиру:
Јанг, Ј., Ши, Кс., Чен, Ј., Ванг, Л., Ву, З., Јао, В., … и Ву, Б. (2026). Идентификација и филогенетска анализа седам сојева Brucella abortus у Џеђангу, Кина. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 16, 1758965.

 

 


Време објаве: 10. јун 2026.