Недавна метагеномска студија открила је изузетно разнолик спектар вируса и бактерија које преносе глодари у провинцији Хејлунгђанг, укључујући вирус Ласа, вирус Амур, салмонелу и Јерсинија пестис.
Истраживање је користилоКомплет за обогаћивање патогене РНК од Macro & Micro-Test, засновано на технологији хватања сонде. Селективним уклањањем рРНК домаћина и других конзервираних фрагмената домаћина, метода је ефикасно задржала микробну РНК, значајно побољшавајући осетљивост детекције патогена. Овај корак обогаћивања РНК патогена био је кључан за постизање високе стопе детекције и пружио је снажну техничку подршку за надзор патогена.
Глодари: Кључни резервоари зоонотских болести
Глодари су врстама најбогатија и широко распрострањена група сисара, која обухвата више од 2.000 врста широм света и чини преко 40% свих врста сисара.
Поред свог еколошког значаја, глодари служе као главни резервоари и вектори бројних зоонотских патогена.Пошто се станишта глодара често преклапају са људским окружењем - путем директних угриза, контакта са излучевинама или индиректног преношења путем бува и гриња - патогени које она садрже представљају сталну претњу јавном здрављу.
Приметно је да више од 70% нових заразних болести потиче од дивљих животиња, а глодари представљају један од најзначајнијих резервоара вируса.
Погранични регион Хејлунгђанг: Прва линија фронта за надзор патогена
Хејлунгђанг, погранична провинција на североистоку Кине, поседује обилне еколошке ресурсе и дели границе са више земаља. Комбинација богатог биодиверзитета и честог прекограничног кретања становништва ствара повољне услове за пренос патогена.
Између јуна и јула 2021. године, истраживачи су сакупили 67 дивљих глодара из града Хенгдаохези, у граду Муданђанг. Узорци су обухватали:
л 20Полуострво Аподем
л 47Миодес руфоканус
Сви примерци су снимљени у стамбеним подручјима и околним пољопривредним земљиштима, што истиче блиску везу између људских насеља и станишта дивљих животиња.
Технологија обогаћивања патогена: Превазилажење сметњи у позадини домаћина
У метагеномском секвенцирању, РНК домаћина обично доминира очитавањима секвенцирања, маскирајући сигнале патогена са малом количином.
Да би се решио овај изазов, студија је користилаКомплет за метагеномску детекцију патогена компаније Macro & Micro-Test. Користећи технологију хватања сонде, посебно дизајниране сонде се везују за рРНК домаћина и конзервиране секвенце, омогућавајући њихово исцрпљивање и тиме обогаћивање микробне РНК.
Овај приступ је значајно побољшао осетљивост детекције патогена, омогућавајући да секвенцирањем након секвенцирања добије већи удео очитаних патогена. Корак обогаћивања поставио је солидну основу за прецизну карактеризацију спектра патогена које носе глодари.
Након обогаћивања, узорци РНК су подвргнути реверзној транскрипцији, изградњи библиотеке и секвенцирању високог протока. Биоинформатичка анализа је обухватала:
Филтрирање генома домаћина
Таксономска класификација помоћу Kraken2
Корекција бројности помоћу папратне папрат
Овај ток рада је генерисао свеобухватан профил вирусних и бактеријских заједница.
Резултати истраживања: Коциркулација више вируса и бактерија
Вирални налази
Детектовани вируси припадали су 21 вирусној породици, укључујућиАренавиридеиХантавириди.
Крозде новосклапањем помоћу Мегахита, генерисано је 154 вирусна контига, од којих је 110 поравнато са 19 вируса из осам породица.
In Полуострво Аподем, идентификовани су следећи вируси:
л Аренавируси: Ласса вирус, Вензхоу вирус, Гаиро вирус
л Хантавируси: Амур вирус, Пуумала вирус
In Миодес руфоканус, откривени су пацовски артеривирус и амурски вирус.
Међу овим патогенима:
Ласа вирус је узрочник вирусне хеморагичне грознице, са стопом смртности која достиже приближно 20%.
Амурски вирус је један од патогена одговорних за хеморагичну грозницу са бубрежним синдромом (ХГС). Кина извештава о највећем глобалном терету хантавирусних инфекција.
Бактеријски налази
Укупно је анотирано 1.051 бактеријских родова.
Најбројнији родови били су:
лСалмонела(26–31%)
лЈерсинија(11–23%)
Салмонелаје главни патоген који се преноси храном, одговоран за процењених 9 милиона случајева тифуса и приближно 110.000 смртних случајева годишње широм света.
Јерсинија пестис, узрочник куге, одговоран је за три историјске пандемије. Провинција Хејлунгђанг је препозната као једно од природних жаришта куге у Кини и остаје приоритетни регион за надзор куге.
Значај студије
Научни доприноси
Ова студија представља први извештај о фрагментима вируса Ласа и вирусу артеритиса пацова код глодара из Хејлунгђанга, проширујући кинеску базу података о патогенима које преносе глодари.
Систематски карактерише вирусне и бактеријске заједнице у локалним популацијама глодара, пружајући основне податке за надзор зоонотских болести у пограничним регионима.
Импликације по јавно здравље
Резултати указују на потребу за континуираним надзором и скринингом патогенаА. полуострваиМ. руфоканус.
Подаци пружају научне доказе који подржавају стратегије контроле извора за болести као што су куга и хеморагијска грозница са бубрежним синдромом.
Методолошке предности
Метагеномско секвенцирање омогућава непристрасно откривање и познатих и нових патогена.
У овој студији, технологија обогаћивања патогена компаније Macro & Micro-Test показала је снажне перформансе, ефикасно побољшавајући детекцију циљних патогена у сложеним биолошким узорцима. Резултати потврђују њену способност да подржи високоосетљиву идентификацију патогена у надзору дивљих животиња.
Препорука производа
На основу успешне примене у овој студији, комплет за обогаћивање патогене РНК за макро и микро тестове се топло препоручује за метагеномска истраживања надзора.
Ефикасним смањењем нуклеинских киселина домаћина и обогаћивањем микробних секвенци, комплет значајно побољшава осетљивост детекције и квалитет података. Представља суштински алат за прецизно откривање патогена у сложеним узорцима и пружа робусну техничку подршку за надзор јавног здравља, процену ризика од зооноза и припремљеност за епидемије.
Contact to learn more: marketing@mmtest.com
Време објаве: 02.03.2026.