Недавна студија објављена уМикробиомспровели су метагеномску анализу вируса на 846 дивљих малих сисара - укључујући слепе мишеве, глодаре и ровке - сакупљених у Сијера Леонеу, Западна Африка. Студија је идентификовала укупно 39 РНК вируса повезаних са сисарима, укључујући 26 нових и 13 раније познатих вируса. Међу њима, породица Paramyxoviridae показала је највећу разноликост, док су глодари садржали највећи број вирусних врста (n = 26).
Процена ризика од зооноза открила је три позната зоонотска вируса - вирус енцефаломиокардитиса, вирус Ласа и Rocahepevirus sp. - као и три вируса са потенцијалним ризиком од преливања: Melian вирус, вирус хепатитиса глодара и Hunnivirus A. Приметно је да је међу новоидентификованим вирусима, Batledantevirus 2 показао најближу филогенетску везу са вирусом Le Dantec који зарази људе. Серолошка анализа је даље открила неутралишућа антитела против овог вируса код 2,8% локалних становника, што указује на претходну, вероватно неоткривену, изложеност људи.
Ови налази истичу присуство значајног резервоара вируса којим доминирају глодари у Западној Африци и наглашавају кључни значај интегрисаних стратегија надзора на интерфејсу човек-животиња. Комбиновање метагеномског скрининга са серолошком валидацијом пружа робустан оквир за идентификацију вируса са зоонотским потенцијалом и потенцијалом преливања.
Током протекле деценије, више од 60% нових заразних болести код људи потиче од животињских резервоара, а слепи мишеви, глодари и ровке су препознати као кључни домаћини зоонотских вируса. Африка се сматра жариштем зоонотских болести. На пример, Сијера Леоне је пријавила преко 28.000 случајева током епидемије еболе 2014–2016. године.
Упркос значајном терету зоонотских болести у овом региону, разноврсност и дистрибуција вируса код дивљих малих сисара остају недовољно окарактерисане. Да би се попунила ова празнина, истраживачи су спровели систематску анализу вирома 846 дивљих малих сисара ухваћених на три локације у Сијера Леонеу између 2018. и 2023. године. Студија је имала за циљ да окарактерише вирусну разноврсност, идентификује кандидате са потенцијалом за пренос између врста, процени ризик од зооноза и генерише доказе који подржавају системе раног упозоравања на нове заразне болести.
Основне методе
Студија је применила свеобухватни ток рада вирусне метагеномике:
- Обрада узорка:Ткива срца, јетре, слезине, плућа и бубрега су сакупљена, обједињена, хомогенизована и подвргнута екстракцији тоталне РНК.
- Секвенцирање и склапање:Деплеција рибозомалне РНК је извршена пре изградње библиотеке, након чега је уследило секвенцирање високог протока коришћењем платформе Illumina NovaSeq 6000. Вирусни контизи су састављени de novo.
- Идентификација вируса:Вируси су идентификовани на основу поравнања гена РНК-зависне РНК полимеразе (RdRp). Задржани су само вируси повезани са кичмењацима, искључујући бактеријске, гљивичне и биљне вирусе.
- Биоинформатичка анализа:Спроведене су филогенетска реконструкција, анализа рекомбинације, моделирање мреже преноса између врста и процена ризика од зооноза.
- Серолошка валидација:За Batledantevirus 2 развијен је тест неутрализације псеудовируса заснован на VSV-у. Неутрализујућа антитела су откривена у 2,8% људских серума, што пружа доказе о потенцијалном зоонотском преносу.
СтудијаРезултати
1. Откривање и разноликост вируса
Ова студија је спровела транскриптомску анализу секвенцирања на 846 дивљих животиња сакупљених у Сијера Леонеу, укључујући глодаре, слепе мишеве и ровке. На основу комплетних секвенци гена РНК-зависне РНК полимеразе (RdRp), идентификовано је укупно 39 РНК вируса повезаних са сисарима, укључујући 13 раније познатих вируса и 26 нових вируса.
Што се тиче вирусног састава, породица Paramyxoviridae показала је највећи ниво разноликости у сва три реда домаћина, а затим следе Astroviridae и Picornaviridae. Што се тиче дистрибуције домаћина, глодари су допринели највећој вирусној разноликости, са укупно 26 вирусних врста, што указује на њихову истакнуту улогу као резервоара вирусне разноликости у региону.
2. Зоонотски ризик
Процена ризика од зооноза идентификовала је три позната зоонотска вируса: вирус енцефаломиокардитиса, вирус Ласа и врсте Rocahepevirus. Поред тога, три вируса - Melian вирус, вирус хепатитиса глодара и Hunnivirus A - идентификовани су као вируси који имају потенцијални ризик од преливања.
Међу 26 новооткривених вируса, за четири је предвиђен висок зоонотски потенцијал на основу филогенетских и геномских карактеристика. Приметно је да је Batledantevirus 2 показао најближу филогенетску везу са познатим вирусом Le Dantec који зарази људе.
Накнадна серолошка испитивања додатно су потврдила овај налаз, јер су неутралишућа антитела против Batledantevirus 2 откривена у 2,8% серума локалних становника. Овај резултат сугерише да су се непрепознате или асимптоматске инфекције можда већ догодиле унутар људске популације, што указује на потенцијални, али претходно неоткривени зоонотски пут преноса.
3. Динамика преноса између врста
Анализа међуврсног преноса показала је да глодари заузимају централну позицију у мрежи за дељење вируса, делујући као кључни чворови који олакшавају размену вируса између врста домаћина. Укупно 15 вируса је идентификовано као потенцијал за међуврсни пренос.
Даља анализа образаца унакрсног преноса показала је да се дељење вируса чешће дешава међу домаћинима унутар истог таксономског реда, што сугерише да повезаност домаћина игра важну улогу у динамици преноса. Насупрот томе, слепи мишеви су показали релативно нижи капацитет за унакрсни пренос.
Важно је напоменути да су код одређених вируса примећени докази о ширењу опсега домаћина. На пример, Мелијан вирус, који се раније сматрао специфичним за ровке, такође је откривен код глодара у овој студији, што указује на потенцијалну промену у прилагодљивости домаћина и повећан ризик од ширег преношења.
Закључци и импликације по јавно здравље
- Висока разноликост вирома код дивљих малих сисара:Откриће 39 РНК вируса, укључујући 26 нових врста, открива велики резервоар вируса у региону и први пут извештава о новим вирусима са високим зоонотским потенцијалом (нпр., Batledantevirus 2).
- Глодари као приоритетне мете надзора:Глодари делују као кључна чворишта за пренос вируса и носе највећу вирусну разноликост, што представља највећи ризик од преливања.
- Потреба за интегрисаним стратегијама надзора:Налази подржавају давање приоритета глодарима у програмима активног надзора и спровођење интегрисаних приступа који комбинују метагеномику, серологију и еколошки мониторинг на границама између људи и дивљих животиња.
Генерално, ова студија пружа кључне доказе који подржавају системе раног упозоравања и оквире за процену ризика за нове зоонотске болести, појачавајући важност проактивног надзора у регионима високог ризика.
Информације о производу
Време објаве: 23. март 2026.