Ново оружје за дијагнозу туберкулозе и откривање отпорности на дрогу: нова генерација циљана секвенцирање (ТНГС) у комбинацији са машинским учењем за дијагнозу преосјетљивости туберкулозе
Извештај о књижевности: ЦЦА: Дијагностички модел заснован на ТНГС и у учењу машина, који је погодан за људе са мање бактеријске туберкулозе и туберкулозним менингитисом.
Назив тезе: Туберкулозна јефинирана секвенцирање следеће генерације и машинско учење: ултразљива дијагностичка стратегија за паучеве плућне цевастице и цевасти менингитис.
Периодично: "Цлиница Цхимица Ацта"
Ако: 6.5
Датум објаве: јануар 2024
У комбинацији са Универзитетом у Кинеској академији наука и пекиншког грудног болнице, Макро и микро-тест основао је модел дијаберкулозе на основу нове генерације циљаних секвенцирања (ТНГС) технологије и начина учења машина, који је ултра висок осетљивост на откривање туберкулозе са неколико бактерија и туберкулозних менингитиса, пружила је нову методу дијагнозе преосјетљивости за клиничку дијагнозу два Врсте туберкулозе и помогли су тачан дијагнозу, откривање отпорности на лекове и лечење туберкулозе. У исто време, откриве се да се пацијентова плазма ЦФДНА може користити као погодан тип узорка за клиничко узорковање у дијагнози ТБМ-а.
У овој студији, 227 узорака плазме и узорака цереброспиналних течности коришћене су за успостављање два клиничка кохорта, у којима су коришћени лабораторијски дијагностички узорци за дијагностику за успостављање модела учења машине за дијагнозу туберкулозе, а клиничка дијагностичка узорка кохорта коришћена су за верификацију утврђених Дијагностички модел. Сви узорци први су били намењени посебно дизајнираним циљаним базеном снимања снимања за микобактеријуму туберкулозу. Затим, на основу података о секвенцирању ТБ-ТНГС-а, модел стабла одлука користи се за обављање 5-фоллосних унакрсних валидација о сеновима за обуку и валидацију лабораторијских дијагностичких реда и дијагностички прагови узорака плазме и узорака цереброспиналних течности. Добијени праг доведени су у два испитивања реда за откривање клиничких дијагноза и дијагностичке перформансе ученика процењују се кривуља РОЦ. Коначно је добијени модел дијагнозе туберкулозе.
Слика 1 Схематски дијаграм истраживачког дизајна
Резултати: Према специфичним праговима узора ЦСФ ДНК (АУЦ = 0,974) и узорак ЦФДНА у плазми (АУЦ = 0,908) утврђен је у овој студији, између 227 узорака, осетљивост ЦСФ узорака је била 97,01%, специфичност је била 95,65% и Осетљивост и специфичност узорака у плазмима су 82,61% и 86,36%. У анализи 44 упарена узорка ПЛАСМА ЦФДНА и цереброспиналне флуидне ДНК од пацијената са ТБМ-ом, дијагностичка стратегија ове студије има велику конзистентност од 90,91% (40/44) у ПЛАСМА ЦФДНА и цереброспиналну флуидну ДНК и да је осетљивост 95,45% (42/44). Код деце са плућном туберкулозом, дијагностичка стратегија ове студије је осетљивија на узорке плазме од резултата детекције Ксперт-а у узорцима желучаног сока од истих пацијената (28,57% - 15,38%).
Сл. 2 Анализа Перформансе дијаграма дијаграма туберкулозе за узорке становништва
Сл. 3 Дијагностички резултати упарених узорака
ЗАКЉУЧАК: У овој студији је основана преосетљива дијагностичка метода туберкулозе, што може да пружи дијагностичко средство са највишим осетљивошћу на откривање клиничких пацијената са олигобациларном туберкулозом (негативна култура). Откривање преосјетљиве туберкулозе на основу плазме ЦФДНА може бити погодан узорак типа за дијагнозу активне туберкулозе и туберкулозних менингитиса (узорака у плазмима је лакше прикупити од цереброспиналне течности за пацијенте осумњичене за туберкулозу за мозак).
Оригинална веза: хттпс: //ввв.сцисерирецт.цом/сциенце/артицле/пии/С0009898123004990? виа% 3дихуб
Кратак увођење производа за откривање макро и микро-тестирања туберкулозе
С обзиром на компликоване узорке пацијената са пацијентима туберкулозе и разних потреба, макро и микро-тест пружа комплетан сет НГС решења за екстракцију узорака за укапљивање, куалцомм библиотеке изградње и секвенцирања и анализа података. Производи покривају брзу дијагнозу пацијената са туберкулозом, откривање отпорности на лекове, куцање микобактеријске туберкулозе и НТМ, дијагнозу преосјетљивости, негативног туберкулозе и туберкулозних људи итд.
Серијски комплети за откривање туберкулозе и микобактерија:
Предмет бр | Назив производа | Садржај испитивања производа | врста узорка | Применљиви модел |
ХВТС-3012 | Агент за ослобађање узорака | Користи се у ликвидном лечењу узорака испљувка, добио је први класни број записа, машине за машине за сутонг 20230047. | испљувак | |
ХВТС-НГС-П00021 | Комплет за откривање квалитета Куалцомм за преосјетљиве туберкулозе (метода хватања сонде) | Неинвазивна (течна биопсија) Претпостављање преосјетљивости за бактерије-негативна плућна туберкулоза и нодула мозга; Узорци људи који се сумња да су заражени туберкулозом или не-туберкулозом Микобактерија су анализирани високим секвенцирањем метагеномије, а информације о откривању да ли су туберкулоза или не-туберкулоза микобактерија заражене и главна информисања о преноћивању на лекове на линији микобактеријума били су обезбеђени. | Периферна крв, алвеоларна течност за испирање, хидроТорак и асцитес, узорак пункције у фокусу, цереброспинална течност. | Друга генерација |
ХВТС-НГС-Т001 | Комплет за откривање отпорности на микобактерију и отпорност на дрогу (метода секвенцирања мултиплекса | Мицобацтериум тест за куцање, укључујући МТБЦ и 187 НТМ;Откривање отпорности на лекове Мицобацтериум туберкулоза обухвата 13 лекова и 16 основних мутацијских места гена отпорности на лекове. | Спутум, алвеоларни течност за испирање, хидроТОРАКС и асцитес, узорак пункције у фокусу, цереброспинална течност. | Двојна платформа друге / треће генерације |
Истакнути: ХВТС-НГС-Т001 МИЦОБАЦТЕМ ТИТИРАЊЕ И Отпорност на дрогу (Много метода појачања)
Увод производа
Производ се заснива на главним лековима прве и друге линије описане у Смјерницама за лечење ВХО ТБ, макролиди и аминогликозиди који се обично користе у Смјерницама за лечење НТМ-ом, а веб локације за отпорност на лекове покривају све једну групу локација везаних за отпорност на лекове Ко је комплекс микобактеријума туберкулозе каталог мутације, као и остали пријављени гени отпорности на лекове и локације мутације у складу са истрагом и статистиком високог бодовања Литературе у земљи и иностранству.
Идентификација за куцање заснована је на соја НТМ самираних у Смјерницама НТМ-а које је објавио кинески часопис туберкулозе и респираторних болести и консензуса стручњака. Дизајнирани уносни прајмери могу појачати, редоследити и напоменути више од 190 НТМ врста.
Кроз циљану технологију АМПЛИФИКАЦИЈА МУЛТИПКЕ ПЦР-а, гени генотипизације и гени отпорни на лекове Мицобацтериум су појачани МУЛТЕКС ПЦР и добијени су комбинација циљаних гена. Појачани производи могу се саградити у библиотеке за секвенцију са високим простанком друге генерације или треће генерације, а све друге генерације и треће генерације редослед секвенцирања треће генерације могу се подвргнути високо дубинским редоследима да би се добиле информације о секвенци циљаних гена. Упоређујући се са познатим мутацијама које се налазе у уграђеној референтној бази података (укључујући комплекс мутације мутације и њен однос са отпорношћу на лекове), утврђене су мутације везане за отпорност на лекове или осетљивост анти-туберкулозе лекова. У комбинацији са самоотвореним раствором узорака спутума Макро и микро-тест, проблем ниске ефикасности амплификације на нуклеинском киселини (десет пута већи од традиционалних метода), тако да је решење резистенције лекова може бити Директно се примењује на клиничке узорке спутума.
Распон детекције производа
34гени повезани отпорност на дрогу18лекови против туберкулозе и6Откривени су лекови НТМ, покривају се297локације отпорности на лекове; Десет врста микобактеријске туберкулозе и више од тога190Откривени су врсте НТМ-а.
Табела 1: Информације од 18 + 6 лекова + 190 + НТМ
Предност производа
Снажна клиничка прилагодљивост: узорци спутума могу се директно открити са агентом за само-укапљивање без културе.
Експериментални рад је једноставан: Први круг операције појачања је једноставан, а изградња библиотеке је завршена за 3 сата, што побољшава ефикасност рада.
Свеобухватно отпорност на куцање и дроге: Покривање типова и отпорности на лекове МТБ и НТМ, који су кључне тачке клиничке забринутости, тачног отпорности на отпорности и отпорности на дрогама, подржавајући независни софтвер за анализу и генерисање извештаја о анализи и генерисању извештаја о анализи.
Компатибилност: Компатибилност производа, прилагођавање маинстреам ИЛМ и МГИ / ОНТ платформама.
Спецификација производа
Код производа | Назив производа | Платформа за откривање | спецификације |
ХВТС-НГС-Т001 | Комплет за откривање отпорности на микобактерију и отпорност на дрогу (метода мултиплексије појачања) | Онт, Иллумина, МГИ, Салус Про | 16 / 96РКСН |
Вријеме поште: Јан-23-2024